Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SRPK1Q96SB4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK1Q96SB4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK1Q96SB4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms