Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNAQ96QF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GCNAQ96QF7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GCNAQ96QF7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms