Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU4

UHRF2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF2Q96PU4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UHRF2Q96PU4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UHRF2Q96PU4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UHRF2Q96PU4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UHRF2Q96PU4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UHRF2Q96PU4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms