Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AGAP3Q96P47 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGAP3Q96P47 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGAP3Q96P47 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms