Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCLT1Q96NL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCLT1Q96NL6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCLT1Q96NL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms