Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RILPQ96NA2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RILPQ96NA2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RILPQ96NA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms