Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COG8Q96MW5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COG8Q96MW5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms