Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RNF145Q96MT1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RNF145Q96MT1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF145Q96MT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms