Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JSRP1Q96MG2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
JSRP1Q96MG2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
JSRP1Q96MG2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms