Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NSMCE2Q96MF7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NSMCE2Q96MF7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms