Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD0

PDXP, Pyridoxal phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXPQ96GD0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDXPQ96GD0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDXPQ96GD0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDXPQ96GD0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms