Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PIK3IP1Q96FE7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3IP1Q96FE7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms