Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINGO1Q96FE5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINGO1Q96FE5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LINGO1Q96FE5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms