Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM11Q96F44 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM11Q96F44 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms