Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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NEURL3Q96EH8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NEURL3Q96EH8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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NEURL3Q96EH8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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NEURL3Q96EH8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NEURL3Q96EH8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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