Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC126Q96EE4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC126Q96EE4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms