Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPDL1Q96EA4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPDL1Q96EA4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms