Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAF2Q96CS3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAF2Q96CS3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAF2Q96CS3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms