Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF1Q96CC6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDF1Q96CC6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDF1Q96CC6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms