Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EME1Q96AY2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EME1Q96AY2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms