Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC74AQ96AQ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74AQ96AQ1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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