Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1AQ96AJ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
VTI1AQ96AJ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VTI1AQ96AJ9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms