Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX21Q969T3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX21Q969T3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX21Q969T3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms