Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC10Q969S8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HDAC10Q969S8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC10Q969S8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC10Q969S8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HDAC10Q969S8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC10Q969S8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC10Q969S8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC10Q969S8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC10Q969S8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HDAC10Q969S8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms