Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPS3Q969F9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPS3Q969F9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HPS3Q969F9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms