Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD2Q969F2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKD2Q969F2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKD2Q969F2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms