Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX13Q92968 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PEX13Q92968 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PEX13Q92968 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms