Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF4BQ92750 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TAF4BQ92750 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TAF4BQ92750 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms