Protein–RNA interactions for Protein: Q92604

LPGAT1, Acyl-CoA:lysophosphatidylglycerol acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPGAT1Q92604 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LPGAT1Q92604 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LPGAT1Q92604 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LPGAT1Q92604 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms