Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRPF31Q8WWY3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRPF31Q8WWY3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPF31Q8WWY3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF31Q8WWY3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF31Q8WWY3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF31Q8WWY3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF31Q8WWY3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF31Q8WWY3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF31Q8WWY3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF31Q8WWY3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms