Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CKAP2Q8WWK9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CKAP2Q8WWK9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CKAP2Q8WWK9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms