Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC12Q8WUD4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC12Q8WUD4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC12Q8WUD4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms