Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF42

UBASH3B, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, humanhuman

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3BQ8TF42 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBASH3BQ8TF42 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBASH3BQ8TF42 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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