Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHBDD1Q8TEB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RHBDD1Q8TEB9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHBDD1Q8TEB9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms