Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM71BQ8TC56 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM71BQ8TC56 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM71BQ8TC56 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms