Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEDD1Q8NHV4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEDD1Q8NHV4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NEDD1Q8NHV4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms