Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG50

RDM1, RAD52 motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1Q8NG50 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RDM1Q8NG50 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDM1Q8NG50 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms