Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC148Q8NFR7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC148Q8NFR7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms