Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NUP43Q8NFH3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NUP43Q8NFH3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NUP43Q8NFH3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms