Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APPL2Q8NEU8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APPL2Q8NEU8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APPL2Q8NEU8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms