Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C17orf47Q8NEP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C17orf47Q8NEP4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms