Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CNNM3Q8NE01 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNNM3Q8NE01 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNNM3Q8NE01 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
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