Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND76

CCNY, Cyclin-Y, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYQ8ND76 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCNYQ8ND76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCNYQ8ND76 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCNYQ8ND76 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms