Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N9G6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N9G6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N9G6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N9G6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N9G6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q8N9G6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N9G6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N9G6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N9G6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N9G6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N9G6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N9G6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N9G6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q8N9G6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q8N9G6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8N9G6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8N9G6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8N9G6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8N9G6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8N9G6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8N9G6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q8N9G6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8N9G6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8N9G6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8N9G6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8N9G6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8N9G6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q8N9G6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Q8N9G6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8N9G6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q8N9G6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8N9G6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8N9G6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8N9G6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8N9G6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q8N9G6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q8N9G6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q8N9G6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q8N9G6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q8N9G6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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