Protein–RNA interactions for Protein: Q8N468

MFSD4A, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4AQ8N468 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MFSD4AQ8N468 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MFSD4AQ8N468 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MFSD4AQ8N468 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms