Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J5

PPM1K, Protein phosphatase 1K, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1KQ8N3J5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPM1KQ8N3J5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPM1KQ8N3J5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPM1KQ8N3J5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms