Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 ANO10-209ENST00000436073 497 ntTSL 415.68■□□□□ 0.18e-10■■■■■ 29.6
AGGF1Q8N302 ANO10-208ENST00000428831 641 ntTSL 515.01□□□□□ -0.018e-10■■■■■ 29.6
AGGF1Q8N302 ANO10-217ENST00000495772 631 ntTSL 311.89□□□□□ -0.518e-10■■■■■ 29.6
AGGF1Q8N302 ANO10-210ENST00000439141 560 ntTSL 47.44□□□□□ -1.228e-10■■■■■ 29.6
AGGF1Q8N302 ANO10-204ENST00000413397 511 ntTSL 45.87□□□□□ -1.478e-10■■■■■ 29.6
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AGGF1Q8N302 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-10■■■■■ 29.5
AGGF1Q8N302 ERGIC1-209ENST00000520642 539 ntTSL 414.84□□□□□ -0.031e-10■■■■■ 29.5
AGGF1Q8N302 ERGIC1-207ENST00000520326 647 ntTSL 514.09□□□□□ -0.151e-10■■■■■ 29.5
AGGF1Q8N302 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 29.5
AGGF1Q8N302 TERF2IP-203ENST00000569234 639 ntTSL 219.25■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 29.5
AGGF1Q8N302 TERF2IP-202ENST00000564671 1266 ntTSL 210.95□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 29.5
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AGGF1Q8N302 FAM239B-202ENST00000424415 2194 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.678e-7■■■■■ 29.4
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AGGF1Q8N302 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 315.42■□□□□ 0.063e-8■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 CCR6-203ENST00000400926 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -11e-10■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.21e-10■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.431e-10■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.511e-10■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 GOLGA3-204ENST00000534967 484 ntTSL 324.58■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 IFITM10-203ENST00000482459 1563 ntTSL 1 (best)24.08■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 C9orf3-207ENST00000445181 873 ntTSL 323.43■■□□□ 1.342e-12■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 CTBP1-211ENST00000511907 900 ntTSL 318.59■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 418.31■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 GIGYF1-202ENST00000464111 656 ntTSL 318.02■□□□□ 0.481e-6■■■■■ 29.4
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AGGF1Q8N302 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 515.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 GIGYF1-203ENST00000471340 478 ntTSL 515.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 29.4
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AGGF1Q8N302 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 29.4
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AGGF1Q8N302 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 IFITM10-202ENST00000382123 3807 ntTSL 314.53□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 29.4
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AGGF1Q8N302 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 C9orf3-221ENST00000489562 646 ntTSL 213.87□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 29.4
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AGGF1Q8N302 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 412.29□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 29.4
AGGF1Q8N302 CHFR-219ENST00000541341 581 ntTSL 311.09□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 29.4
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AGGF1Q8N302 PDS5B-202ENST00000447833 906 ntTSL 47.31□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 29.4
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AGGF1Q8N302 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.167e-24■■■■■ 29.3
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AGGF1Q8N302 RPS6KB1-202ENST00000393021 5479 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 29.3
AGGF1Q8N302 RPS6KB1-201ENST00000225577 5375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 29.3
AGGF1Q8N302 PLA2G6-214ENST00000448094 1147 ntTSL 518.44■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 29.3
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AGGF1Q8N302 PLA2G6-201ENST00000332509 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 29.3
AGGF1Q8N302 PLA2G6-224ENST00000490473 601 ntTSL 411.01□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 29.3
AGGF1Q8N302 MTA3-209ENST00000454356 1702 ntTSL 530.78■■■□□ 2.528e-9■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.148e-9■■■■■ 29.1
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AGGF1Q8N302 MTA3-205ENST00000407270 2202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.848e-9■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 MTA3-216ENST00000484780 563 ntTSL 49.65□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 MTA3-207ENST00000430763 758 ntTSL 59.28□□□□□ -0.928e-9■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.988e-9■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 MTA3-208ENST00000433553 706 ntTSL 48.78□□□□□ -18e-9■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.198e-9■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 MTA3-219ENST00000493983 413 ntTSL 56.73□□□□□ -1.338e-9■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 WDR27-211ENST00000546525 3511 ntTSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.378e-11■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 WDR27-208ENST00000479310 1289 ntTSL 518.2■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-8■■■■■ 29.1
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AGGF1Q8N302 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 29.1
AGGF1Q8N302 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.41e-11■■■■■ 29
AGGF1Q8N302 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-11■■■■■ 29
AGGF1Q8N302 NAPA-206ENST00000594155 416 ntTSL 57.64□□□□□ -1.193e-10■■■■■ 29
AGGF1Q8N302 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.517e-7■■■■■ 29
AGGF1Q8N302 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.317e-7■■■■■ 29
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