Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHOT1Q8IXI2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT1Q8IXI2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms