Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN4Q8IWV2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTN4Q8IWV2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms