Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HERC6Q8IVU3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HERC6Q8IVU3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HERC6Q8IVU3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms